T-COFFEE, Version_1.41(Fri Jun 28 14:24:48 MDT 2002)
Notredame, Higgins, Heringa, JMB(302)pp205-217,2000
CPU TIME:6 sec.
SCORE=61
*
 BAD AVG GOOD
*
Gorilla    :  67
Human      :  67
Dog        :  67
Bovine     :  67
Horse      :  67
Caiman     :  53
Goldfish   :  53
dogfish    :  49

Gorilla    VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESF-GDLSTPDAVMGNPK
Human      VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESF-GDLSTPDAVMGNPK
Dog        VHLTAEEKSLVSGLWGKVNVDEVGGEALGRLLIVYPWTQRFFDSF-GDLSTPDAVMSNAK
Bovine     -MLTAEEKAAVTAFWGKVKVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESF-GDLSTADAVMNNPK
Horse      VQLSGEEKAAVLALWDKVNEEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFDSF-GDLSNPGAVMGNPK
Caiman     SPFSAHEEKLIVDLWAKVDVASCGGDALSRMLIIYPWKRRYFEHF-GKLSTDQDVLHNEK
Goldfish   VEWTDAERSAIIGLWGKLNPDELGPQALARCLIVYPWTQRYFATF-GNLSSPAAIMGNPK
dogfish    VHWTGEEKALVNAVWTKTDHQAVVAKALERLFVVYPWTKTYFVKFNGKFHAS-----DST

Cons          :  *.  :  .* * .      .** * :::***.: :*  * *.:        : .


Gorilla    VKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFKLLGNVLVCVLAHHFG
Human      VKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFG
Dog        VKAHGKKVLNSFSDGLKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNVLVCVLAHHFG
Bovine     VKAHGKKVLDSFSNGMKHLDDLKGTFAALSELHCDKLHVDPENFKLLGNVLVVVLARNFG
Horse      VKAHGKKVLHSFGEGVHHLDNLKGTFAALSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVVVLARHFG
Caiman     IREHGKKVLASFGEAVKHLDNIKGHFAHLSKLHFEKFHVDCENFKLLGDIIIVVLGMHHP
Goldfish   VAAHGRTVMGGLERAIKNMDNIKATYAPLSVMHSEKLHVDPDNFRLLADCITVCAAMKFG
dogfish    VQTHAGKVVSALTVAYNHIDDVKPHFVELSKKHYEELHVDPENFKLLANCLEVELGHALH

Cons       :  *. .*: .:  .  ::*::*  :. **  * :::*** :**:**.: :    .    


Gorilla    KE-FTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
Human      KE-FTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
Dog        KE-FTPQVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
Bovine     KE-FTPVLQADFQKVVAGVANALAHRYH
Horse      KD-FTPELQASYQKVVAGVANALAHKYH
Caiman     KD-FTLQTHAAFQKLVRHVAAALSAEYH
Goldfish   PSGFNADVQEAWQKFLSVVVSALCRQYH
dogfish    KE-FTPEVQAAWSKFSNVVVDALSKGYH

Cons        . *.   :  :.*.   *. **.  **