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Dottup (Bioweb) |
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Réalisation d'un dotplot simple. |
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JDotter |
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Réalisation d'un dotplot (nécessite le module Java). |
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Dotlet |
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Réalisation d'un dotplot (nécessite le module Java). |
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EMBOSS-Needle |
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Alignement global avec needle. |
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Stretcher |
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Alignement global. |
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Blast du NCBI |
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Alignement local avec blast (banques interrogées : Genbank, EMBL, DDBJ, PDB). |
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FASTA EBI |
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Alignement local avec FASTA. Plus sélectif que Blast, mais moins rapide. |
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LALIGN |
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Alignement local entre deux séquences. Compare deux séquences nucléotidiques ou protéiques et détermine les segments ayant les meilleurs scores. |
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MultAlin |
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Réalise un alignement multiple et présente les résultats sous forme de séquences colorées avec détermination d'une séquence consensus. |
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Phylip |
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Construction des arbres phylogénétiques. |
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ClustalW |
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Alignement multiple et construction des arbres phylogénétiques. |
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TCoffee (IGS) ou Tcoffee (EMBNET) |
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Réalise un alignement multiple et détermine une séquence consensus. Il présente également les séquences alignées sous différents formats (ClustalW, Phylip...). |
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