Biosciences et Techniques
Collection dirigée par Jean Figarella et André Calas
 
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exercice 15 : PrEdiction d’un gEne procaryote : de la sEquence nuclEique A la structure 3D

 

1. Recherche des cadres ouverts de lecture

Fichier séquence : seq_exo15.txt

Adresse ORFinder du NCBI web

Résultat obtenu avec ORFinder : fichier sortie screen

 

2 et 3. Séquence de la protéine

Séquence correspondant à l'ORF 457 à 1545 nt : seq_proteine.txt

 

4. Analyse Protaparam

Adresse : protparam d'EXAPSY web

Résultat : sortie_protparam.htm

 

5. Analyse Psipred

Adresse : Psipred web

Résultat : sortie_psipred.pdf

6. Analyse Swiss-Model

Adresse : Swiss Model web

Résultat : sortie_swiss_model.pdb

 




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