Biosciences et Techniques
Collection dirigée par Jean Figarella et André Calas
 
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exercice 3 (complet) : La glucose-6-phosphate dEshydrogEnase (G6PD) humaine

Enoncé

Le portail ExPASy ("Expert Protein Analysis System") est un serveur de protéomique dédié à l’analyse des séquences et des structures protéiques.

Il rassemble :
- Swiss-Prot : une banque de séquences protéiques annotées manuellement ;
- ENZYME : une base de données consacrée aux enzymes, leur nomenclature et leur classification ;
- SWISS-2D-PAGE : des données de protéines identifiées par électrophorèse sur gel polyacrylamide ;
- Swiss-Model : outil de modélisation 3D par homologie ;
- "Tools and software packages" : des outils d’analyse et de traitement et de modélisation des protéiques.

1. A l’aide du numéro de classification de la G6PD, retrouver la fiche complète de l’enzyme sur le site ExPASy.

2.
Récupérer la séquence primaire de la protéine au format FASTA.

3.
Repérer le lien qui renvoie vers la structure 3D disponible dans la base PDB ("Protein Data Bank").

4.
Réaliser une fiche de synthèse sur cette enzyme.

 




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