Biosciences et Techniques
Collection dirigée par Jean Figarella et André Calas
 
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Exercice 11 : Localisation d’introns d’un gEne par alignement global de sEquences

 

1. Récupération des séquences

Fichier séquence gène de la chaîne bêta : sequence_gene_HBB.txt

Fichier séquence ARNm : sequence_arnm.txt

 

2. Alignement global

Adresse needle sur EBI web

Fichier sortie de résultat needle : sortie_needle11.htm

 

3. Réalisation d'un dotplot

Outil Dottup sur bioweb pasteur web

Fichier sortie de résultat dottup : sortie_dottup11.png

dotplot
Sortie doptplot : ARNm versus gène

Organisation du gène de la chaîne bêta : Gene ID 3043 web

hbb
Organisation du gène de la chaîne bêta de l'hémoglobine humaine

 



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